Algumas semanas antes da E3, a Nintendo havia dito que no modo online de Super Mario Maker 2 não seria possível convidar amigos para as partidas, mas sim que elas seriam realizadas com jogadores aleatórios. Isso repercutiu negativamente para a comunidade, mas parece que a Nintendo ouviu os fãs desta vez.
Durante a Nintendo Treehouse: Live na E3 2019, Takashi Tezuka, da Nintendo, disse que fará mudanças no jogo para que os jogadores sejam combinados com amigos durante as partidas online. Você agora poderá convidar um amigo para um modo multiplayer online, em vez de jogar com jogadores aleatórios como antes dito. Tezuka terminou dizendo que uma atualização está planejada para após o lançamento do jogo, que acontece no final deste mês.